Merge pull request #6147 from RosettaCommons/sergey/f switching integration.mpi test to run in release_debug mode

• Summary
• integration.mpi 「24」

Merge pull request #6148 from RosettaCommons/dougrenfrew/remove_legacy_dunbrack_functions Remove legacy rotlib functions that caused array bounds warnings with GCC v10.3

• Summary
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「1」
• integration.tutorials 「1」
• maintenance.documentation

Merge pull request #6146 from RosettaCommons/roccomoretti/fix_master_tests2 Fix clang_tidy warning in master Be explicit about which virtual function is being called during constructor. (This is easy, as it's the most-derived class which is calling things.)

• Summary
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「3」
• integration.release_debug 「2」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• scientific.antibody_h3_modeling
• scientific.docking
• scientific.glycan_dock
• scientific.make_fragments.debug
• scientific.make_fragments
• scientific.mp_f19_ddG_of_mutation
• scientific.mp_lipid_acc

Merge pull request #6142 from RosettaCommons/nannemdp/vicinity_sampling_by_LoopRelaxMover Added if statement to LoopRelaxMover to bypass centroid setup when not remodeling the loop.

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「1」
• integration.mpi 「3」
• integration.release_debug 「3」
• integration 「3」
• maintenance.documentation
• profile 「1」

initiating clean rebuild

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「1」
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「1」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• integration 「3」
• maintenance.documentation
• profile 「1」

Merge pull request #6144 from RosettaCommons/jyjwang/degreaser-documentation-1 updating documentation

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「1」
• integration.addsan 「2」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「4」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• integration 「3」
• scientific.glycan_dock
• mac.clang.unit.release 「4」
• linux.gcc.cxx11thread.serialization.unit 「4」
• m1.clang.python39.unit 「4」
• mac.clang.unit 「4」
• ubuntu-20.04.gcc.python39.unit 「3」
• ubuntu-22.04.gcc.python39.unit 「3」

Merge pull request #6122 from RosettaCommons/roccomoretti/update_rdkit Update RDKit Due to interest, update the version of RDKit to 2021.03.5. This version is the same one being used in Foldit (PR #5590) and should be C++14 compatible. Compilation issues seem to be sorted out if I explicitly ignore some of the new subdirectories in RDKit, which should be okay-ish, as they aren't used elsewhere in RDKit, and aren't used currently by Rosetta. (More extensive fixes may be necessary if we start to use those features.)

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「3」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「2」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• integration 「2」
• mac.clang.unit.release 「4」
• gcc-11.gcc.python39.unit 「4」
• gcc-9.gcc.unit 「4」
• linux.clang.unit 「4」
• m1.clang.python39.unit 「4」
• mac.clang.unit 「4」
• ubuntu-20.04.gcc.python39.unit 「4」

initiating clean rebuild

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「1」
• integration.mpi 「6」
• integration 「2」

Merge pull request #6139 from RosettaCommons/jtseffer/ERMS_prediction_app_steepness Fixed typo in rigid dimer steepness for app SID_ERMS_prediction.

• Summary
• code_quality.clang_tidy 「3」
• integration.mpi 「6」
• integration 「2」
• profile 「13」
• mac.clang.unit.release 「3」
• linux.clang.unit 「4」
• linux.gcc.unit 「4」
• mac.clang.unit 「4」