Merge pull request #6371 from RosettaCommons/lyskov/pyrosetta-patch-1 PyRosetta, fixing distributed error handling

• Summary
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「2」
• integration.mpi 「1」
• integration.tensorflow 「1」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• performance 「6」
• scientific.make_fragments.debug
• scientific.make_fragments
• scientific.mp_f19_tilt_angle
• scientific.mp_lipid_acc
• unit.valgrind 「9」

beautifying

• Summary
• PyRosetta.notebook 「15」
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「2」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「1」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• performance 「5」
• linux.clang.python39.release.PyRosetta.Debug
• scientific.mp_f19_tilt_angle
• unit.valgrind 「9」

Merge pull request #6367 from RosettaCommons/JackMaguire-cartmd-vrt-fix Remove divide-by-zero in CartesianMD There's a snippet of code in the run_rattle1() function that divides some numbers by the mass of each atom. This PR just adds a check to skip loop iterations where that mass is zero. Thanks Frank for the help and the review!

• Summary
• beautification
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「3」
• integration.addsan 「2」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「1」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• performance 「4」
• scientific.sb_score12_docking
• unit.valgrind 「9」

Merge pull request #6365 from RosettaCommons/guangfeng/galiganddock_vsx_update [GALigandDock] Added final ligand only minimization to speed up VSX virtual screening.

• Summary
• beautification
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「2」
• integration.addsan 「2」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「3」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• integration 「1」
• unit.valgrind 「9」

Merge pull request #6366 from RosettaCommons/hbeval_fix_mb Updated HBEval such that if the long and short range poly_BAHs listed…

• Summary
• beautification
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「2」
• integration.release_debug 「5」
• integration.tensorflow 「1」
• integration.thread 「1」
• integration 「5」
• linux.clang.score 「1」
• linux.gcc.score 「1」
• mac.clang.score 「1」

Merge pull request #6364 from RosettaCommons/dimaio/relax_disulfide_weirdness Remove disulfide-only packing.

• Summary
• beautification
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「2」
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「1」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• performance 「3」
• scientific.ddg_ala_scan
• scientific.fragments_picking.debug
• scientific.make_fragments.debug
• scientific.make_fragments

Merge pull request #6210 from RosettaCommons/amuenks/lig_elec_for_merge Amuenks/lig elec for merge

• Summary
• beautification
• code_quality.clang_analysis 「1」
• code_quality.clang_tidy 「2」
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「1」
• integration.release_debug 「5」
• integration.tutorials 「1」
• integration.ubsan 「1」
• integration 「4」
• performance 「3」
• scientific.mp_lipid_acc