Fix correctness bugs: broken operator< and off-by-one residue loops (#701) Two unrelated families of correctness bugs found by an audit pass. Continues the patterns from #696 (broken comparison operators) and #695 (off-by-one residue loops).

• Summary
• ubuntu-20.04.clang.cxx11thread.serialization.python310.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.clang.cxx11thread.serialization.python311.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.clang.cxx11thread.serialization.python312.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.clang.cxx11thread.serialization.python313.PyRosetta.unit
• ubuntu-20.04.clang.cxx11thread.serialization.python314.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.gcc.cxx11thread.serialization.python310.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.gcc.cxx11thread.serialization.python311.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.gcc.cxx11thread.serialization.python312.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.gcc.cxx11thread.serialization.python313.PyRosetta.unit 「1」
• ubuntu-20.04.gcc.cxx11thread.serialization.python314.PyRosetta.unit 「1」
• code_quality.clang_tidy 「1」
• integration.addsan 「1」
• integration.mpi 「1」
• integration.tutorials 「1」
• maintenance.documentation
• scientific.mp_lipid_acc